馬肉は高タンパク・低カロリーでかつ、低アレルギー食品であることから、食用の肉としては最高の肉とも言えます。口の中に入れるとほのかな甘みを感じますが、これはグリコーゲンを多く含むためです。グリコーゲンの含有量は、牛肉の３倍以上とも言われていて、その他、ペプチド、リノレン酸も多く含む食肉です。
また、ミネラルのカルシウムは、牛肉、豚肉の３倍、鉄分は、ほうれん草、ひじきより豊富で、豚肉の４倍、鶏肉の１０倍。
低アレルギー食品であることも重要ですが、狂牛病（BSE）や口蹄疫とも無縁です。馬は奇蹄類です。狂牛病（BSE）や口蹄疫は偶蹄類（牛・豚・羊）にのみ起こる病気ですから奇蹄類の馬はそれらの病気にはかかりません。
女性に最も不足していると言われている２大栄養素「カルシウム」「鉄分」により、冷え性・貧血を予防補給するには最適な食べ物です。
※ 馬肉と牛肉・豚肉の栄養素 比較 (100g)
| 馬 | 牛 | 豚 | 備 考 | |
| カロリー (kcal) | 110 | 299 | 202 | 約半分以下 |
| たんぱく質 (g) | 20.1 | 18.4 | 18.9 | |
| 脂質 (g) | 2.5 | 23.3 | 12.8 | 1/5以下 |
| カルシウム (mg) | 11 | 5 | 5 | |
| リン (mg) | 170 | 140 | 17.8 | |
| 鉄分 (mg) | 4.3 | 1.3 | 1.1 | 食肉の中で最高量 |
| グリコーゲン (mg) | 2290 | 674 | 432 | 3倍以上 |